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168期在線課堂|動植物基因組組裝工具和策略介紹

來源: 安諾基因   2019-7-30   訪問量:1746評論(0)

隨著測序平臺的不斷革新與發展,測序通量不斷提升,測序價格也隨之下跌,越來越多的未知物種基因組序列被研究者破譯解碼。對于基礎研究來說,高質量的參考基因組就像基石,基石的質量決定建筑高度,也直接影響文章發表的level。那么如何制定完備的組裝策略?如何打造高質量的參考基因組?別急,本期在線交流我們將邀請高級信息分析工程師全力為大家解答~


PacBio三代測序技術以其超長讀長、無GC偏好性、高一致性準確度以及可靈活選擇的CLR和CCS兩種測序模式等優勢深受廣大科研工作者的青睞。同時,三代測序技術能夠彌補二代測序技術在基因組組裝應用中reads短、組裝難度大、無法跨越重復序列區域等局限。PacBio三代測序技術已經成為基因組組裝的金標準,已發表包含小麥、甘蔗、藜麥、山羊、蠑螈在內的多篇高分基因組文章。

今年5月,安諾優達首批引進2臺PacBio Sequel II測序平臺,目前已實現穩定運行,交付項目數十個,完成了基于Sequel II平臺的多個基因組建庫、測序、組裝分析。本期在線課堂,我們將一起分享最新的數據進展。

欲知基因組組裝更多精彩內容,安諾基因在線交流平臺將為您一一解答,本周三下午15:00,我們在線上等你~

 

本期交流


交流時間:2019年7月31日,15:00-16:00

交流主題:動植物基因組組裝工具和策略介紹

交流內容:

  • De novo測序平臺和技術發展背景介紹

  • 常用基因組組裝工具介紹(Canu、WTDBG、Falcon等)

  • 高質量的參考基因組組裝策略

  • Sequel II實測數據展示和組裝案例

交流平臺:安諾基因生物信息交流QQ 1群及2群(475638865)同步交流

交流形式:視頻/語音實時交流

主持人:三代測序產品經理

主講人:高級信息分析工程師

注:新入群的老師請務必備注姓名和工作單位

 

自2017年推出三代測序服務以來,安諾優達先后引進了10臺PacBio Sequel和2臺Sequel II測序儀,產品服務類型涵蓋三代基因組組裝、人重測序、動植物重測序、全長轉錄組測序等;累計完成三代項目超800+,其中組裝經驗涉及中草藥、林木、農作物、海洋生物、哺乳動物、昆蟲和人等。日前,安諾優達宣布啟動了ATCG(Annoroad Typical Chinese Genomes Database)數據庫二期計劃,旨在建立“二代+三代”中國人群基因組數據庫,助力挖掘中國人群特有的可靠變異,進一步推動三代測序在中國人群健康研究中的應用。



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